Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSR2Q969E8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR2Q969E8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms