Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms