Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AVL9Q8NBF6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AVL9Q8NBF6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms