Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms