Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS6Q8IU80 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms