Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf39Q6ZRI6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf39Q6ZRI6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf39Q6ZRI6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf39Q6ZRI6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf39Q6ZRI6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf39Q6ZRI6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf39Q6ZRI6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C15orf39Q6ZRI6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms