Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRAIDQ6UW56 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATRAIDQ6UW56 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms