Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDF2Q6PJF5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF2Q6PJF5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDF2Q6PJF5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDF2Q6PJF5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDF2Q6PJF5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDF2Q6PJF5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDF2Q6PJF5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDF2Q6PJF5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDF2Q6PJF5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms