Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFXN4Q6P4A7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFXN4Q6P4A7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFXN4Q6P4A7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms