Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EEF1A1P5Q5VTE0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EEF1A1P5Q5VTE0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms