Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms