Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTXN3Q4LDR2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms