Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SP6Q3SY56 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP6Q3SY56 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms