Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TYSND1Q2T9J0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TYSND1Q2T9J0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms