Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 DDX39B-220ENST00000482195 1232 ntTSL 28.03□□□□□ -1.121e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DDX39B-215ENST00000462256 4027 ntTSL 27.45□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 DDX39B-207ENST00000427214 1005 ntTSL 55.16□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 KMT2E-214ENST00000495267 1133 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.064e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 KMT2E-209ENST00000478990 1500 ntTSL 514.82□□□□□ -0.044e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 KMT2E-203ENST00000334884 6840 ntTSL 512.78□□□□□ -0.364e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 KMT2E-206ENST00000474203 617 ntTSL 37.12□□□□□ -1.274e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 KMT2E-212ENST00000482560 1759 ntTSL 55.1□□□□□ -1.594e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.11e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 TAF1D-207ENST00000527169 1127 ntTSL 514.3□□□□□ -0.121e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 211.96□□□□□ -0.51e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 TAF1D-206ENST00000527068 1023 ntTSL 56.7□□□□□ -1.341e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.42e-8■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.338e-7■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 ATG4B-217ENST00000475693 2237 ntTSL 214.92□□□□□ -0.028e-7■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 514.03□□□□□ -0.168e-7■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.318e-7■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.388e-7■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 ATG4B-201ENST00000344376 1566 ntTSL 512.63□□□□□ -0.398e-7■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.48e-7■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.324e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.34e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.294e-6■□□□□ 11.3
SRSF7Q16629 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.036e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.016e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.596e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 311.36□□□□□ -0.596e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.626e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-237ENST00000636732 5073 ntTSL 511.12□□□□□ -0.636e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-206ENST00000564557 582 ntTSL 310.82□□□□□ -0.686e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-215ENST00000569020 535 ntTSL 410.52□□□□□ -0.736e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-213ENST00000568158 496 ntTSL 310.37□□□□□ -0.756e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-7■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-220ENST00000569916 599 ntTSL 310.25□□□□□ -0.776e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.856e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-233ENST00000636179 8984 ntTSL 59.77□□□□□ -0.856e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.866e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.876e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 SETD5-224ENST00000486465 886 ntTSL 29.18□□□□□ -0.946e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.996e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.026e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.086e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 HIST1H2BJ-203ENST00000607124 950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.16e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-245ENST00000638087 9339 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.16e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.146e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-208ENST00000565697 385 ntTSL 37.85□□□□□ -1.156e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-247ENST00000639389 1414 ntTSL 57.71□□□□□ -1.176e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-207ENST00000565605 739 ntTSL 47.66□□□□□ -1.186e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.286e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.346e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.396e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.426e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-238ENST00000636820 9115 ntTSL 55.78□□□□□ -1.486e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.546e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.546e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 HIST1H2BJ-202ENST00000606923 408 ntTSL 35.36□□□□□ -1.556e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.596e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.616e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.776e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 KDM1A-204ENST00000481879 525 ntTSL 33.51□□□□□ -1.856e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ERH-204ENST00000557697 167 ntTSL 50.21□□□□□ -2.386e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 517.91■□□□□ 0.465e-9■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.525e-9■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.575e-9■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ATG4B-213ENST00000460211 871 ntTSL 211.88□□□□□ -0.511e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ATG4B-210ENST00000428861 580 ntTSL 28.46□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.716e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 HHEX-204ENST00000551454 1307 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.236e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.446e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 PLXNB1-213ENST00000473996 1034 ntTSL 212.08□□□□□ -0.486e-11■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.56e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.816e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 AC008760.2-201ENST00000614781 1357 ntBASIC9.37□□□□□ -0.916e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.976e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 ACSL4-207ENST00000504383 683 ntTSL 25.65□□□□□ -1.56e-6■□□□□ 11.2
SRSF7Q16629 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.262e-6■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.682e-6■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.054e-10■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.074e-10■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.164e-10■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.244e-10■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-8■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HNRNPH1-249ENST00000524180 997 ntTSL 511.42□□□□□ -0.581e-11■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HNRNPH1-243ENST00000522958 580 ntTSL 210.29□□□□□ -0.761e-11■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HNRNPH1-241ENST00000521790 549 ntTSL 26.78□□□□□ -1.321e-11■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HNRNPH1-235ENST00000519943 748 ntTSL 23.87□□□□□ -1.791e-11■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 HNRNPH1-229ENST00000518548 527 ntTSL 22.97□□□□□ -1.931e-11■□□□□ 11.1
SRSF7Q16629 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 45.53□□□□□ -1.521e-10■□□□□ 11
SRSF7Q16629 METAP2-206ENST00000549136 388 ntTSL 25.11□□□□□ -1.591e-10■□□□□ 11
SRSF7Q16629 CAD-206ENST00000464159 589 ntTSL 38.66□□□□□ -1.024e-7■□□□□ 11
SRSF7Q16629 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.562e-12■□□□□ 11
SRSF7Q16629 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.592e-12■□□□□ 11
SRSF7Q16629 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 217.63■□□□□ 0.414e-7■□□□□ 11
SRSF7Q16629 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.314e-7■□□□□ 11
SRSF7Q16629 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.594e-7■□□□□ 11
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