Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms