Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF1Q14990 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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