Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXOSC10Q01780 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC10Q01780 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC10Q01780 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC10Q01780 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC10Q01780 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC10Q01780 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC10Q01780 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC10Q01780 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC10Q01780 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
EXOSC10Q01780 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC10Q01780 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms