Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFITM3Q01628 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFITM3Q01628 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms