Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITX1P78337 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITX1P78337 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX1P78337 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX1P78337 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX1P78337 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX1P78337 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX1P78337 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX1P78337 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITX1P78337 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PITX1P78337 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITX1P78337 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITX1P78337 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITX1P78337 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITX1P78337 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITX1P78337 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITX1P78337 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITX1P78337 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITX1P78337 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITX1P78337 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX1P78337 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX1P78337 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX1P78337 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX1P78337 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX1P78337 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms