Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL23P62829 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL23P62829 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL23P62829 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL23P62829 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL23P62829 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL23P62829 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL23P62829 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL23P62829 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL23P62829 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL23P62829 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL23P62829 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL23P62829 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL23P62829 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms