Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH4P55283 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH4P55283 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH4P55283 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH4P55283 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH4P55283 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH4P55283 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH4P55283 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH4P55283 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH4P55283 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH4P55283 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH4P55283 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH4P55283 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH4P55283 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH4P55283 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH4P55283 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH4P55283 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH4P55283 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms