Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 KIF22-209ENST00000569636 834 ntTSL 511.93□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 30.8
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SUB1P53999 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 RPL3-211ENST00000465618 2108 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 30.8
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SUB1P53999 VPS33B-208ENST00000574755 2356 ntTSL 211.32□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 HAUS4-212ENST00000554406 652 ntTSL 511.03□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 HAUS4-211ENST00000554373 896 ntTSL 511.03□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 30.8
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SUB1P53999 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 RPL3-206ENST00000453303 916 ntTSL 510.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 30.8
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SUB1P53999 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 30.8
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SUB1P53999 UBLCP1-202ENST00000519276 1558 ntTSL 52.49□□□□□ -2.012e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 30.7
SUB1P53999 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PTOV1-205ENST00000595934 1880 nt18.63■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PTOV1-209ENST00000597793 1716 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 DDB1-220ENST00000542337 558 ntTSL 315.11■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 NOC2L-204ENST00000483767 1611 ntTSL 214.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 PTOV1-213ENST00000600105 635 ntTSL 313.71□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 30.7
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