Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NKX2-5P52952 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms