Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RORCP51449 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RORCP51449 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RORCP51449 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RORCP51449 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RORCP51449 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RORCP51449 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RORCP51449 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RORCP51449 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RORCP51449 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RORCP51449 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RORCP51449 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RORCP51449 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RORCP51449 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RORCP51449 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RORCP51449 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RORCP51449 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RORCP51449 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RORCP51449 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RORCP51449 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms