Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES1P49788 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARRES1P49788 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARRES1P49788 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.7 ms