Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRA2P47869 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms