Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC8P31273 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms