Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP1P28562 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms