Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VARSP26640 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VARSP26640 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VARSP26640 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VARSP26640 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VARSP26640 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VARSP26640 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VARSP26640 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VARSP26640 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VARSP26640 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VARSP26640 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VARSP26640 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VARSP26640 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VARSP26640 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VARSP26640 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VARSP26640 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VARSP26640 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VARSP26640 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VARSP26640 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VARSP26640 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VARSP26640 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VARSP26640 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VARSP26640 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VARSP26640 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VARSP26640 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VARSP26640 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VARSP26640 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VARSP26640 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VARSP26640 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VARSP26640 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VARSP26640 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VARSP26640 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VARSP26640 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VARSP26640 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VARSP26640 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms