Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNT1P13805 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNT1P13805 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms