Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT13P13646 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT13P13646 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT13P13646 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT13P13646 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT13P13646 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT13P13646 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT13P13646 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT13P13646 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT13P13646 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT13P13646 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT13P13646 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT13P13646 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT13P13646 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT13P13646 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT13P13646 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT13P13646 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT13P13646 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT13P13646 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT13P13646 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT13P13646 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT13P13646 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT13P13646 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT13P13646 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT13P13646 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT13P13646 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT13P13646 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT13P13646 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT13P13646 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT13P13646 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT13P13646 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT13P13646 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms