Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYF5P13349 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYF5P13349 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYF5P13349 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYF5P13349 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYF5P13349 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MYF5P13349 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYF5P13349 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYF5P13349 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYF5P13349 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYF5P13349 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF5P13349 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF5P13349 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF5P13349 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF5P13349 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF5P13349 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF5P13349 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF5P13349 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF5P13349 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF5P13349 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF5P13349 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF5P13349 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF5P13349 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF5P13349 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF5P13349 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF5P13349 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF5P13349 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF5P13349 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF5P13349 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF5P13349 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF5P13349 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF5P13349 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF5P13349 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF5P13349 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF5P13349 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF5P13349 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF5P13349 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF5P13349 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF5P13349 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF5P13349 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF5P13349 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF5P13349 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF5P13349 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF5P13349 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF5P13349 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF5P13349 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF5P13349 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF5P13349 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF5P13349 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF5P13349 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF5P13349 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms