Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CT47B1P0C2W7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CT47B1P0C2W7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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