Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA4P06727 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA4P06727 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA4P06727 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOA4P06727 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA4P06727 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA4P06727 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA4P06727 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA4P06727 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA4P06727 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms