Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN1O94985 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms