Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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