Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CREB3O43889 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3O43889 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3O43889 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3O43889 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3O43889 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms