Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms