Protein–RNA interactions for Protein: O15320

CTAGE5, Endoplasmic reticulum export factor CTAGE5, humanhuman

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE5O15320 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE5O15320 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTAGE5O15320 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTAGE5O15320 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTAGE5O15320 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTAGE5O15320 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE5O15320 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE5O15320 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE5O15320 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE5O15320 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE5O15320 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE5O15320 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms