Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1I1O14576 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1I1O14576 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms