Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 45.28□□□□□ -1.565e-22■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-10■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.34e-10■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.14e-10■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.943e-16■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 TM9SF1-204ENST00000525592 882 ntTSL 320.38■□□□□ 0.853e-16■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-16■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-16■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 TM9SF1-209ENST00000530468 1065 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-16■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 TM9SF1-205ENST00000528010 904 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-16■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 AL136295.1-201ENST00000530611 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.53e-16■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.423e-20■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.233e-20■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.685e-10■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.365e-10■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 MFSD5-204ENST00000551660 1318 ntTSL 215.58■□□□□ 0.085e-10■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.113e-9■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 EIF6-207ENST00000456600 551 ntTSL 321.64■■□□□ 1.053e-9■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 EIF6-204ENST00000415116 739 ntTSL 521.62■■□□□ 1.053e-9■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 EIF6-206ENST00000447927 932 ntTSL 1 (best)16.81■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 40.5
DDX3XO00571 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.274e-10■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-11■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-11■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.91e-11■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 RNF145-208ENST00000520548 572 ntTSL 48.12□□□□□ -1.111e-11■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 KLHL7-206ENST00000459661 592 ntTSL 517.17■□□□□ 0.341e-11■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.321e-11■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 KLHL7-210ENST00000479288 616 ntTSL 416.86■□□□□ 0.291e-11■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-11■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 KLHL7-213ENST00000521082 3165 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.361e-11■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.852e-15■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 40.4
DDX3XO00571 RETREG2-207ENST00000452293 609 ntTSL 426.8■■□□□ 1.881e-13■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 RETREG2-205ENST00000443757 558 ntTSL 415.95■□□□□ 0.141e-13■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.289e-9■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 HS3ST3B1-202ENST00000466596 2808 ntTSL 216.27■□□□□ 0.29e-9■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-209ENST00000434453 2229 ntTSL 527.17■■□□□ 1.946e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-211ENST00000444719 762 ntTSL 322.83■■□□□ 1.256e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-213ENST00000454132 2922 ntTSL 221.32■■□□□ 16e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-217ENST00000485985 644 ntTSL 221.12■□□□□ 0.976e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 520.87■□□□□ 0.936e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-203ENST00000414218 451 ntTSL 520.87■□□□□ 0.936e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-208ENST00000434278 678 ntTSL 520.64■□□□□ 0.896e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-205ENST00000430278 523 ntTSL 420.46■□□□□ 0.876e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-207ENST00000433968 578 ntTSL 420.46■□□□□ 0.876e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.286e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.246e-12■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.266e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.26e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-221ENST00000583181 505 ntTSL 520.78■□□□□ 0.926e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 520.48■□□□□ 0.876e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.686e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 517.53■□□□□ 0.46e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.366e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-219ENST00000582585 891 ntTSL 517.08■□□□□ 0.326e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-217ENST00000581743 785 ntTSL 516.98■□□□□ 0.316e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-208ENST00000577432 866 ntTSL 516.77■□□□□ 0.286e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 216.73■□□□□ 0.276e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-224ENST00000584411 525 ntTSL 416.56■□□□□ 0.246e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-213ENST00000579198 599 ntTSL 516.24■□□□□ 0.196e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-214ENST00000580296 733 ntTSL 316.16■□□□□ 0.186e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-223ENST00000584192 495 ntTSL 315.17■□□□□ 0.026e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 514.56□□□□□ -0.086e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-210ENST00000578082 841 ntTSL 414.34□□□□□ -0.116e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.266e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 512.76□□□□□ -0.376e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 NARF-215ENST00000580748 577 ntTSL 512.63□□□□□ -0.396e-27■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 DEPDC1B-206ENST00000512452 661 ntTSL 214.14□□□□□ -0.155e-16■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 DEPDC1B-202ENST00000453022 1569 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -15e-16■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.25e-16■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 DEPDC1B-205ENST00000512078 1596 ntTSL 27.3□□□□□ -1.245e-16■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.595e-9■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 PPP1R2-205ENST00000462906 1668 ntTSL 217.94■□□□□ 0.469e-49■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ISG15-202ENST00000624652 657 ntTSL 317.68■□□□□ 0.425e-9■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.345e-9■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 PPP1R2-203ENST00000438848 839 ntTSL 515.93■□□□□ 0.149e-49■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 PPP1R2-201ENST00000413183 706 ntTSL 511.39□□□□□ -0.599e-49■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 PPP1R2-206ENST00000618156 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.749e-49■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-226ENST00000527418 4508 ntTSL 222.07■■□□□ 1.123e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-217ENST00000473905 1181 ntTSL 519.61■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-222ENST00000487956 1145 ntTSL 517.72■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-216ENST00000472434 2894 ntTSL 516.34■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-211ENST00000461564 2751 ntTSL 215.96■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-225ENST00000526491 3091 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-227ENST00000529473 3016 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 40.3
DDX3XO00571 ADAM15-220ENST00000480331 1016 ntTSL 514.49□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 40.3
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