Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms