Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE2AO00408 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE2AO00408 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms