Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3FO00303 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3FO00303 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms