Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms