Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AKR1B1P7-201ENST00000587229 952 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC004134.1-201ENST00000587835 225 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL157392.3-201ENST00000601075 833 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PAX3-202ENST00000336840 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 OR13A1-202ENST00000536058 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PCYT1B-202ENST00000379144 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KRT8P15-201ENST00000425226 1451 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 C22orf15-203ENST00000402217 829 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KRT19P3-201ENST00000507547 828 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SCAMP1-AS1-202ENST00000513755 493 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC100793.3-201ENST00000592440 719 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SMIM17-202ENST00000600547 573 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC011487.2-202ENST00000599707 1356 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC010148.1-203ENST00000413842 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RPL30-201ENST00000287038 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 GNL3-201ENST00000394799 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AL353747.1-201ENST00000404577 267 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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