Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NUBP1-201ENST00000283027 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 USF1-201ENST00000368019 998 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 GMPR2-202ENST00000355299 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TNFAIP1-201ENST00000226225 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 IQCC-201ENST00000291358 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 C3AR1-201ENST00000307637 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZNF540-210ENST00000592533 3147 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 DPP9-201ENST00000262960 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NCBP2-201ENST00000321256 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PHACTR3-203ENST00000361300 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 IKZF5-205ENST00000617859 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FPR2-201ENST00000340023 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 EXT2-201ENST00000343631 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 BX005040.3-201ENST00000611332 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PHB-214ENST00000614445 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TSPAN1-201ENST00000372003 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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LSAMPQ13449 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MAGED2-202ENST00000347546 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TP53-204ENST00000420246 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 DGKA-229ENST00000551156 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TP53-227ENST00000622645 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PAMR1-209ENST00000622144 2785 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 INVS-202ENST00000262457 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AMER3-201ENST00000321420 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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