Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL365259.1-204ENST00000606001 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AP003108.3-201ENST00000623765 2234 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RGL1-201ENST00000304685 5100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CFAP157-202ENST00000373295 1721 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms