Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PARGP1-201ENST00000417555 2286 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ANKRD20A4-201ENST00000357336 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 INTS14-203ENST00000431261 1980 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CDK20-203ENST00000375871 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LYPD5-201ENST00000377950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SNHG14-218ENST00000553108 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 OR13A1-202ENST00000536058 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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